Personer der er så mentalt retarderede, at man ikke fuldt ud kan diagnosticere deres autisme, betegnes med atypisk autisme. Det atypiske kan også ligge i at de autistiske træk er sent udviklede eller kun to af de tre problemkriterier (samspil, kommunikation, forestillingsevne) er opfyldte.

Børn der har ’atypisk autisme’ har også autisme. Autismen viser sig bare på en lidt anden måde end man ser hos de fleste andre børn med autisme. ’Atypisk’ betyder, at det ikke er som det plejer at være.