Når et lægemiddel bliver optaget i kroppen, vil det på et tidspunkt nå hen til leveren. I leveren laves lægemidlet om til et andet molekyle, det nedbrydes, og dette kaldes for metabolisering.

Når et molekyle binder til en receptor og deaktiverer receptoren, kaldes molekylet for en antagonist. En receptor påvirkes derfor antagonistisk af en antagonist.

Når et molekyle binder til en receptor og aktiverer receptoren, kaldes molekylet en agonist. En receptor påvirkes derfor agonistisk af en agonist.

En analog er i lægemiddelindustrien en ny version af det lægemiddel man udvikler. Hvis man ændrer en enkelt ting i sit molekyle, vil den nye version være en analog til den version man startede med. 

I et enzym findes en lille fordybning, hvori substraterne binder sig og bagefter bliver omdannet til produktet. Dette sted kaldes for enzymerne for det aktive site.

I receptore findes også en lille fordybning, hvori liganden binder sig og udøver sin virkning. Dette sted kaldes for receptorerne for et bindingssite.

Et udtryk for hvor meget af den dosis der er givet af et lægemiddel, der er blevet optaget i kroppen og derved er kommet over i blodbanen. Biotilgængeligheden måles derfor ud fra niveauet af lægemidlet i blodet.

Beskriver hvad et lægemiddel gør ved kroppen. Det vil sige at farmakodynamik er hvordan et lægemiddel binder til sit target i kroppen.

I ethvert lægemiddel er der nogle funktionelle grupper som er nødvendige for, at lægemidlet har lige præcis den rigtige virkning. Disse funktionelle grupper danner tilsammen det der kaldes for en farmakofor.

Beskriver hvad kroppen gør ved et lægemiddel (Modsat farmakodynamikken). Det vil sige at farmakokinetik er hvordan lægemidlet bliver ændret i kroppen, enten til det aktive lægemiddel eller til et stof der kan blive udskilt fra kroppen igen.